BLASTP 2.2.11 [Jun-05-2005] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= gi|239745904 PREDICTED: hypothetical protein, partial [Homo sapiens] (306 letters) Database: hs.faa 37,866 sequences; 18,247,518 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gi|239751395 PREDICTED: hypothetical protein, partial [Homo sapi... 612 e-175 gi|239745904 PREDICTED: hypothetical protein, partial [Homo sapi... 612 e-175 gi|169211436 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 397 e-111 gi|116284392 mucin 2 precursor [Homo sapiens] 222 4e-58 gi|239749951 PREDICTED: similar to mucin 2 [Homo sapiens] 203 1e-52 gi|222352122 hypothetical protein LOC284297 [Homo sapiens] 156 2e-38 gi|161019170 mucin 5AC [Homo sapiens] 139 4e-33 gi|153945878 mucin 5, subtype B, tracheobronchial [Homo sapiens] 139 4e-33 gi|239758038 PREDICTED: mucin 3A, cell surface associated, parti... 138 5e-33 gi|189181724 proteoglycan 4 isoform D [Homo sapiens] 134 8e-32 gi|189181722 proteoglycan 4 isoform C [Homo sapiens] 134 8e-32 gi|189181720 proteoglycan 4 isoform B [Homo sapiens] 134 8e-32 gi|67190163 proteoglycan 4 isoform A [Homo sapiens] 134 8e-32 gi|146219843 Snf2-related CBP activator protein [Homo sapiens] 124 1e-28 gi|4505939 DNA-directed RNA polymerase II A [Homo sapiens] 119 3e-27 gi|239752594 PREDICTED: hypothetical protein, partial [Homo sapi... 118 7e-27 gi|239752529 PREDICTED: similar to mucin [Homo sapiens] 115 4e-26 gi|239749213 PREDICTED: mucin 3B, cell surface associated, parti... 113 2e-25 gi|91982772 mucin 17 [Homo sapiens] 112 3e-25 gi|151301154 mucin 6, gastric [Homo sapiens] 111 7e-25 gi|239743291 PREDICTED: mucin 3A, intestinal [Homo sapiens] 110 2e-24 gi|16554449 zonadhesin isoform 3 [Homo sapiens] 105 5e-23 gi|27881494 zonadhesin isoform 6 [Homo sapiens] 105 5e-23 gi|239758058 PREDICTED: similar to mucin, partial [Homo sapiens] 105 7e-23 gi|33286442 BCL6 co-repressor-like 1 [Homo sapiens] 102 3e-22 gi|222418647 mucin 7, secreted precursor [Homo sapiens] 101 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IASTKITSQSTPSLTSLITTTGTSSHNTLGLSSSVDTTKTTSHSTASFTSLIATTETTSH 869 Query: 180 STPTLTPS-STPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRPILT------------- 225 +TP T S +T +T STP+ T S I T +T +PS ++T Sbjct: 870 NTPGFTSSIATTEITSHSTPSFTSS---ITTMETTSRSSPSFTSLITITGSTSHSTASFT 926 Query: 226 -------------PSSTPTLTPSSRPILTRSSTPT 247 PS T ++T + R T STP+ Sbjct: 927 SSITTTETTSHSTPSITSSVTTAER---TFHSTPS 958 Score = 60.1 bits (144), Expect = 2e-09 Identities = 73/199 (36%), Positives = 96/199 (48%), Gaps = 21/199 (10%) Query: 117 TPTLTPSNTPTLTPS-STPTLTPS-STPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPS-SRPILTRSST 173 T + T S T T S +TP T S +T +T S P T SST T TPS S P + S Sbjct: 1 TASFTSSIATTETTSQNTPGFTSSIATTEITSHSPPSFTSSSTTTETPSHSTPGFSSSIA 60 Query: 174 PTLTPS-STPTLTPSSTPTLTPS-STPTLTPS-SRPILTRSSTPTLTPSSRPILTPSSTP 230 T T S ST + T S T T S + P T S + +T STP+ T S I T +T Sbjct: 61 TTETTSHSTASFTSSIATTETMSQNIPGFTSSIATTEITSHSTPSFTSS---ITTTETTS 117 Query: 231 TLTPSSRPIL-----TRSSTPTLTPSSTPTLTPS-NTPTLTPSNTPTLTPSN-----TPT 279 +PS ++ T ST + T S T T T S +T ++T 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TRSSTPTLTPSSRPILTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSTPTLTPSN-------- 260 SS P T + P TPS+T TL PSS ++ TPS+T PS+ Sbjct: 249 LSSSAPPETTAVPP--TPSAT-TLDPSSASAPPETTAAPPTPSATTPAPPSSPAPQETTA 305 Query: 261 TPTLTPSNTP-TLTPSNTPTL---TPSSTPTLTPSSTPTLTPSS 300 P TP+++P TL P + T T +T ++T +T T P+S Sbjct: 306 APITTPNSSPTTLAPDTSETSAAPTHQTTTSVTTQTTTTKQPTS 349 Score = 80.5 bits (197), Expect = 2e-15 Identities = 73/224 (32%), Positives = 103/224 (45%), Gaps = 27/224 (12%) Query: 1 TLTPSNTPTLTPSSPPTLTPSSTPTLTPSSQPILTRSSTPTLTPSSPPTLTPSNTPTLTP 60 TL P N+P ++ TPS+T PSS S P T ++PPT PS T P Sbjct: 153 TLAPVNSPAPQDTTAAPPTPSATTPAPPSS-------SAPPETTAAPPT--PSATTQAPP 203 Query: 61 SNTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPQPILTRSSTPTLTPSSPPTLTPSNTPTLTPSNTPTL 120 S++ P T T P + P TP P SS P T ++PPT + + TP S+ P Sbjct: 204 SSS---APPET-TAAPPTPPATTPAP--PSSSAPPETTAAPPTPS-ATTPAPLSSSAPPE 256 Query: 121 TPSNTPTLTPSSTPTLTPSST--PTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTP 178 T + PT PS+T TL PSS P T ++ P TP+ T + P T P Sbjct: 257 TTAVPPT--PSAT-TLDPSSASAPPETTAAPP------TPSATTPAPPSSPAPQETTAAP 307 Query: 179 SSTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRP 222 +TP +P++ T ++ T + +T +T T P+S P Sbjct: 308 ITTPNSSPTTLAPDTSETSAAPTHQTTTSVTTQTTTTKQPTSAP 351 >gi|222418645 mucin 7, secreted precursor [Homo sapiens] Length = 377 Score = 101 bits (252), Expect = 7e-22 Identities = 97/320 (30%), Positives = 145/320 (45%), Gaps = 41/320 (12%) Query: 3 TPSNTPTL-TPSSPPTLTPSSTPTLTPSSQPILTRSSTPTLT-PSSPPTLTPSNTPTLTP 60 +P+N P P PP ++ + P+ ++ + P++T PS+ +T T P Sbjct: 77 SPNNPPKFPNPHQPPKHPDKNSSVVNPT---LVATTQIPSVTFPSASTKITTLPNVTFLP 133 Query: 61 SNTPTL-------TPSSTPTLTPSSTPTLTPQPILTRSSTPTLTPSSPPTLTPSNTPTL- 112 N T+ T SS TL P ++P PQ TP+ T +PP+ + T Sbjct: 134 QNATTISSRENVNTSSSVATLAPVNSPA--PQDTTAAPPTPSATTPAPPSSSAPPETTAA 191 Query: 113 --TPSNTPTLTPSNTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRPILTR 170 TPS T PS++ ++ P P++TP SS P T ++ P TPS Sbjct: 192 PPTPSATTQAPPSSSAPPETTAAPPTPPATTPAPPSSSAPPETTAAPP--TPS------- 242 Query: 171 SSTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRPILTPSSTP 230 ++TP SS P T + P TPS+T TL PSS +S P T ++ P TPS+T Sbjct: 243 ATTPAPLSSSAPPETTAVPP--TPSAT-TLDPSS------ASAPPETTAAPP--TPSATT 291 Query: 231 TLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSTP-TLTPSNTPTL---TPSNTPTLTPSNTPTLTPSSTP 286 PSS ++ P TP+S+P TL P + T T T ++T T T P+S P Sbjct: 292 PAPPSSPAPQETTAAPITTPNSSPTTLAPDTSETSAAPTHQTTTSVTTQTTTTKQPTSAP 351 Query: 287 TLTPSSTPTLTPSSLWHQVI 306 S L +L +++I Sbjct: 352 GQNKISRFLLYMKNLLNRII 371 Score = 88.2 bits (217), Expect = 8e-18 Identities = 85/284 (29%), Positives = 124/284 (43%), Gaps = 33/284 (11%) Query: 44 PSSPPTLTPSNTPTLTPSNTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPQPILTRSSTPTLTPSSPP- 102 P PP+ P+N P + P P ++ + T P +T S T + P Sbjct: 72 PKLPPS--PNNPPKFPNPHQPPKHPDKNSSVVNPTLVATTQIPSVTFPSASTKITTLPNV 129 Query: 103 TLTPSNTPTL-------TPSNTPTLTPSNTPTLTPSSTPTLTPSST-PTLTPSSRPILTR 154 T P N T+ T S+ TL P N+P ++ TPS+T P SS P T Sbjct: 130 TFLPQNATTISSRENVNTSSSVATLAPVNSPAPQDTTAAPPTPSATTPAPPSSSAPPETT 189 Query: 155 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SSS---APPET-TAAPPTPPATTPAP--PSSSAPPETTAAPPTPS-ATTPAPLSSSAPPE 256 Query: 121 TPSNTPTLTPSSTPTLTPSST--PTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTP 178 T + PT PS+T TL PSS P T ++ P TP+ T + P T P Sbjct: 257 TTAVPPT--PSAT-TLDPSSASAPPETTAAPP------TPSATTPAPPSSPAPQETTAAP 307 Query: 179 SSTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRP 222 +TP +P++ T ++ T + +T +T T P+S P Sbjct: 308 ITTPNSSPTTLAPDTSETSAAPTHQTTTSVTTQTTTTKQPTSAP 351 >gi|169217460 PREDICTED: similar to Mucin-6, partial [Homo sapiens] Length = 350 Score = 100 bits (249), Expect = 2e-21 Identities = 94/312 (30%), Positives = 150/312 (48%), Gaps = 28/312 (8%) Query: 3 TPSNTPTLTPSSPPTLTPSSTPTLTPSSQPILTRSSTPTLTPSS---PPTLTPSNTPTLT 59 TPS+ T P+ P P ST +TPS+ ++T + T +S PT T TL Sbjct: 11 TPSHPQTTLPTHVP---PFSTSLVTPSTHTVITPTHAQMATSASIHSTPTGTIPPLTTLM 67 Query: 60 PSNTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPQPILTRSSTPTLTPSSP-PTLTPSNTPTLTPSNTP 118 + + P TPT + +S + T +S + T S+ P +TP+ T +T + P Sbjct: 68 NTGSTHTAPPVTPTTSGTSQAASSFSTAKTSTSLHSHTSSTHHPEVTPTATTKITTN--P 125 Query: 119 TLTPSNTP---TLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRPILTRSSTPT 175 T S+TP T + +S+ TP +T + + S P+ SST +T +S T TP+ Sbjct: 126 TSIGSSTPMAHTTSATSSRLTTPFTTHSPSTGSSPV---SSTGPMTATSFQTTTTYPTPS 182 Query: 176 LTPSSTPTLTPS-STPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRS---STPTLTPSSRPILTPSSTPT 231 L+ ++ PT P ST +TPS+ +TP + T + STPT T + P +T Sbjct: 183 LSQTTLPTYVPPFSTSLVTPSTHTVITPPRTQMATSASIHSTPTGT------IPPPTTLK 236 Query: 232 LTPSSRPILTRSSTPTLTPSSTPTLTPSNTPTLTPSNTPTLTPSNTPTLTPSSTPTLTPS 291 T S+ TR+ T + T + +L + T T S+T + ++ P T +ST +TP+ Sbjct: 237 ATGSTHTAPTRTLTTSGTSQALSSLNTAKTSTSLHSHT---SSTHHPEATSTSTTNITPN 293 Query: 292 STPTLTPSSLWH 303 T T T + + H Sbjct: 294 PTSTGTGTPVAH 305 Score = 93.2 bits (230), Expect = 3e-19 Identities = 94/321 (29%), Positives = 149/321 (46%), Gaps = 33/321 (10%) Query: 2 LTPSNTPTLTPSSPPTLTPS---STPTLT-PSSQPILTRSSTPTLTPSSPPTL-TPSNTP 56 +TPS +TP+ T + STPT T P ++ ST T P +P T T Sbjct: 31 VTPSTHTVITPTHAQMATSASIHSTPTGTIPPLTTLMNTGSTHTAPPVTPTTSGTSQAAS 90 Query: 57 TLTPSNTPTLTPSST-----PTLTPSSTPTLTPQPILTRSSTP---TLTPSSPPTLTPSN 108 + + + T T S T P +TP++T +T P SSTP T + +S TP Sbjct: 91 SFSTAKTSTSLHSHTSSTHHPEVTPTATTKITTNPTSIGSSTPMAHTTSATSSRLTTPFT 150 Query: 109 TPTLTPSNTPTLTPSNTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSRP-ILTRSSTPTLTPSSRPI 167 T + + ++P S+T +T +S T T TP+L+ ++ P + ST +TPS+ + Sbjct: 151 THSPSTGSSPV---SSTGPMTATSFQTTTTYPTPSLSQTTLPTYVPPFSTSLVTPSTHTV 207 Query: 168 LTRSSTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSTPTLTPSSRPILTRSSTPTLTPSSRPILTPS 227 +T T T +S + + T T+ P +T T S+ TR+ T + T + L + Sbjct: 208 ITPPRTQMATSAS---IHSTPTGTIPPPTTLKATGSTHTAPTRTLTTSGTSQALSSLNTA 264 Query: 228 STPT-----LTPSSRPILTRSSTPTLTPSSTPTLTPSNTP---TLTPSNTPTLTPSNTPT 279 T T + + P T +ST +TP+ PT T + TP T + +++ TP T + Sbjct: 265 KTSTSLHSHTSSTHHPEATSTSTTNITPN--PTSTGTGTPVAHTTSATSSRLTTPFTTHS 322 Query: 280 LTPSSTPTLTPSSTPTLTPSS 300 STP SST +T +S Sbjct: 323 PPTGSTPI---SSTGPVTATS 340 Score = 85.1 bits (209), Expect = 7e-17 Identities = 96/336 (28%), Positives = 142/336 (42%), Gaps = 63/336 (18%) Query: 4 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Search results were obtained with NCBI BLAST and RefSeq entries.
Guide to the Human Genome
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