BLASTP 2.2.11 [Jun-05-2005] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= gi|239740773 PREDICTED: similar to diffuse panbronchiolitis critical region 1 [Homo sapiens] (1400 letters) Database: hs.faa 37,866 sequences; 18,247,518 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gi|239740773 PREDICTED: similar to diffuse panbronchiolitis crit... 2761 0.0 gi|238624188 diffuse panbronchiolitis critical region 1 protein ... 1796 0.0 gi|239754269 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 341 3e-93 gi|239740674 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 341 3e-93 gi|239740645 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 341 3e-93 gi|113417486 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 339 1e-92 gi|239740898 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 339 1e-92 gi|239513940 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 339 1e-92 gi|169168665 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 338 3e-92 gi|239740777 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 338 3e-92 gi|239740724 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 338 3e-92 gi|239740827 PREDICTED: hypothetical protein XP_002344067 [Homo ... 335 1e-91 gi|116284392 mucin 2 precursor [Homo sapiens] 319 1e-86 gi|91982772 mucin 17 [Homo sapiens] 259 1e-68 gi|239508976 PREDICTED: mucin 12, cell surface associated [Homo ... 233 1e-60 gi|189181720 proteoglycan 4 isoform B [Homo sapiens] 228 2e-59 gi|67190163 proteoglycan 4 isoform A [Homo sapiens] 228 2e-59 gi|239743293 PREDICTED: mucin 12 [Homo sapiens] 226 1e-58 gi|189181724 proteoglycan 4 isoform D [Homo sapiens] 221 4e-57 gi|189181722 proteoglycan 4 isoform C [Homo sapiens] 221 4e-57 gi|153945878 mucin 5, subtype B, tracheobronchial [Homo sapiens] 203 8e-52 gi|151301154 mucin 6, gastric [Homo sapiens] 194 7e-49 gi|239754668 PREDICTED: mucin 12 [Homo sapiens] 193 1e-48 gi|167736355 mucin 4 isoform a [Homo sapiens] 190 7e-48 gi|239757995 PREDICTED: similar to hCG1747327, partial [Homo sap... 180 1e-44 gi|239743291 PREDICTED: mucin 3A, intestinal [Homo sapiens] 176 1e-43 gi|161019170 mucin 5AC [Homo sapiens] 174 4e-43 gi|239749951 PREDICTED: similar to mucin 2 [Homo sapiens] 155 3e-37 gi|16554449 zonadhesin isoform 3 [Homo sapiens] 153 1e-36 gi|27881494 zonadhesin isoform 6 [Homo sapiens] 153 1e-36 >gi|239740773 PREDICTED: similar to diffuse panbronchiolitis critical region 1 [Homo sapiens] Length = 1400 Score = 2761 bits (7157), Expect = 0.0 Identities = 1400/1400 (100%), Positives = 1400/1400 (100%) Query: 1 MDTVLVLLLGLQALAGPSPKPQKDSVSDWAIVLITLTLVAAIVSLMYGIKKACQFRREMS 60 MDTVLVLLLGLQALAGPSPKPQKDSVSDWAIVLITLTLVAAIVSLMYGIKKACQFRREMS Sbjct: 1 MDTVLVLLLGLQALAGPSPKPQKDSVSDWAIVLITLTLVAAIVSLMYGIKKACQFRREMS 60 Query: 61 LGCGCGSVTPYSSHHEGEAASQRYSCQMKGATTFQEYQKTGELSTSDHIFPLTPGLVYSI 120 LGCGCGSVTPYSSHHEGEAASQRYSCQMKGATTFQEYQKTGELSTSDHIFPLTPGLVYSI Sbjct: 61 LGCGCGSVTPYSSHHEGEAASQRYSCQMKGATTFQEYQKTGELSTSDHIFPLTPGLVYSI 120 Query: 121 PFDHIVLHSGQRPPELPKSTEIHEQKRHCNTTRHSKPTDKPTGNSKTIDHKSSTDNHEAP 180 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1260 Query: 1261 SESSTGSETTRASTSATEVTTAMTTAMTTGSETAVVSTKAPVTTTQSGFSTATVMPAKTT 1320 SESSTGSETTRASTSATEVTTAMTTAMTTGSETAVVSTKAPVTTTQSGFSTATVMPAKTT Sbjct: 1261 SESSTGSETTRASTSATEVTTAMTTAMTTGSETAVVSTKAPVTTTQSGFSTATVMPAKTT 1320 Query: 1321 TASVSTTASTTLYQNTIDSVAKSVPTMDSTIASKSTTLSKIVSVPTAVFIKAPETTTGSE 1380 TASVSTTASTTLYQNTIDSVAKSVPTMDSTIASKSTTLSKIVSVPTAVFIKAPETTTGSE Sbjct: 1321 TASVSTTASTTLYQNTIDSVAKSVPTMDSTIASKSTTLSKIVSVPTAVFIKAPETTTGSE 1380 Query: 1381 ITLASIITSGTTAVCDYIGL 1400 ITLASIITSGTTAVCDYIGL Sbjct: 1381 ITLASIITSGTTAVCDYIGL 1400 >gi|238624188 diffuse panbronchiolitis critical region 1 protein [Homo sapiens] Length = 1393 Score = 1796 bits (4651), Expect = 0.0 Identities = 962/1296 (74%), Positives = 1009/1296 (77%), Gaps = 50/1296 (3%) Query: 90 GATTFQEYQKTGELSTSDHIFPLTPGLVYSIPFDHIVLHSGQRPPELPKSTEIHEQKRHC 149 GATTFQEYQKTGELSTSDHIFPLTPGLVYSIPFDHIVLHSGQRPPELPKSTEIHEQKRHC Sbjct: 28 GATTFQEYQKTGELSTSDHIFPLTPGLVYSIPFDHIVLHSGQRPPELPKSTEIHEQKRHC 87 Query: 150 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Search results were obtained with NCBI BLAST and RefSeq entries.
Guide to the Human Genome
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