BLASTP 2.2.11 [Jun-05-2005] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= gi|239752523 PREDICTED: intestinal mucin-like, partial [Homo sapiens] (514 letters) Database: hs.faa 37,866 sequences; 18,247,518 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gi|239752523 PREDICTED: intestinal mucin-like, partial [Homo sap... 983 0.0 gi|239757995 PREDICTED: similar to hCG1747327, partial [Homo sap... 629 e-180 gi|239743291 PREDICTED: mucin 3A, intestinal [Homo sapiens] 332 6e-91 gi|239508973 PREDICTED: similar to Mucin-3A [Homo sapiens] 324 1e-88 gi|239749213 PREDICTED: mucin 3B, cell surface associated, parti... 232 5e-61 gi|239758038 PREDICTED: mucin 3A, cell surface associated, parti... 224 2e-58 gi|116284392 mucin 2 precursor [Homo sapiens] 223 3e-58 gi|169171850 PREDICTED: similar to intestinal mucin MUC3B [Homo ... 202 8e-52 gi|239749951 PREDICTED: similar to mucin 2 [Homo sapiens] 183 4e-46 gi|153945878 mucin 5, subtype B, tracheobronchial [Homo sapiens] 172 9e-43 gi|161019170 mucin 5AC [Homo sapiens] 167 2e-41 gi|239752529 PREDICTED: similar to mucin [Homo sapiens] 167 3e-41 gi|239758058 PREDICTED: similar to mucin, partial [Homo sapiens] 166 4e-41 gi|91982772 mucin 17 [Homo sapiens] 160 2e-39 gi|239754269 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 159 8e-39 gi|239740674 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 159 8e-39 gi|239740645 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 159 8e-39 gi|169168665 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 154 2e-37 gi|113417486 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 154 2e-37 gi|239740898 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 154 2e-37 gi|239740777 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 154 2e-37 gi|239740724 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 154 2e-37 gi|239513940 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 154 2e-37 gi|239740827 PREDICTED: hypothetical protein XP_002344067 [Homo ... 153 4e-37 gi|151301154 mucin 6, gastric [Homo sapiens] 151 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ITRSTPTSETTYPTSPTSTVKGSTTSIRYSTSMTGTLSMETSLPPTSSSLPTTETATTPT Sbjct: 121 ITRSTPTSETTYPTSPTSTVKGSTTSIRYSTSMTGTLSMETSLPPTSSSLPTTETATTPT 180 Query: 181 TNLVTTEITSHSTPSFSSSTIHSTVSTPTTVISSGPPTSGTIVTSITVTPSSLSTDIPLT 240 TNLVTTEITSHSTPSFSSSTIHSTVSTPTTVISSGPPTSGTIVTSITVTPSSLSTDIPLT Sbjct: 181 TNLVTTEITSHSTPSFSSSTIHSTVSTPTTVISSGPPTSGTIVTSITVTPSSLSTDIPLT 240 Query: 241 TPTTITHHSVGSTESLLTATDLTSTFTVSSSSAMSTSDIPSSPSIQNTETSSLVSMTSAT 300 TPTTITHHSVGSTESLLTATDLTSTFTVSSSSAMSTSDIPSSPSIQNTETSSLVSMTSAT Sbjct: 241 TPTTITHHSVGSTESLLTATDLTSTFTVSSSSAMSTSDIPSSPSIQNTETSSLVSMTSAT 300 Query: 301 IPSVRPTFTSTHNTLTSSLLTTFPGTYSFSSSMSASSDGTTHTETITSLPASTSTLHTTA 360 IPSVRPTFTSTHNTLTSSLLTTFPGTYSFSSSMSASSDGTTHTETITSLPASTSTLHTTA Sbjct: 301 IPSVRPTFTSTHNTLTSSLLTTFPGTYSFSSSMSASSDGTTHTETITSLPASTSTLHTTA 360 Query: 361 ESTTAHTTTTSFTTSTTMESPSSSVATTSTGQTTFSSSTATFTETTTLTPTTDFSEETLT 420 ESTTAHTTTTSFTTSTTMESPSSSVATTSTGQTTFSSSTATFTETTTLTPTTDFSEETLT Sbjct: 361 ESTTAHTTTTSFTTSTTMESPSSSVATTSTGQTTFSSSTATFTETTTLTPTTDFSEETLT 420 Query: 421 TAMTSTPPITSSITPTNTVTSMTTMTSWPTATNTLSSLTTNILSSTPVPSTERTTSHTTN 480 TAMTSTPPITSSITPTNTVTSMTTMTSWPTATNTLSSLTTNILSSTPVPSTERTTSHTTN Sbjct: 421 TAMTSTPPITSSITPTNTVTSMTTMTSWPTATNTLSSLTTNILSSTPVPSTERTTSHTTN 480 Query: 481 INPVSTLVTTLPTTITRSTPTAETTYPISSTSTV 514 INPVSTLVTTLPTTITRSTPTAETTYPISSTSTV Sbjct: 481 INPVSTLVTTLPTTITRSTPTAETTYPISSTSTV 514 >gi|239757995 PREDICTED: similar to hCG1747327, partial [Homo sapiens] Length = 1064 Score = 629 bits (1622), Expect = e-180 Identities = 355/502 (70%), Positives = 386/502 (76%), Gaps = 5/502 (0%) Query: 15 QTTFTSSTATFPETITLTPNTNMSRESLMTPMTSTTPITSAITPTNTVTSMTTMTSPPTT 74 QT FTSSTAT PET TLT ++S ESL T MTSTTP+ SAITP TVTSMTT S PTT Sbjct: 460 QTPFTSSTATSPETTTLTCTNDISTESLTTAMTSTTPVISAITPKTTVTSMTTTASGPTT 519 Query: 75 TNSNSTLSSLTSSILSSTLVPSTDMITSHTTNLTRSSPLLATLPTTITRSTPTSETTYPT 134 TN TLSSLTSSILSST P+T++ITSHTT T S L+ TLPT I RSTPTSETTYP Sbjct: 520 TN---TLSSLTSSILSSTPAPNTEVITSHTTTTTPPSTLVTTLPTAIARSTPTSETTYPI 576 Query: 135 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TTSANMEPPSTAVATTGTGQSTFTSSTATFLETTTLTPTTDISTESFMTPMISTTPITSS 876 Query: 433 ITPTNTVTSMTTMTSWPTATNTLSSLTTNILSSTPVPSTERTTSHTTNINPVSTLVTTLP 492 +T NT+TSMTT S PT TNTLSSLT++ILSSTPVPSTE TS TTN STLVTTLP Sbjct: 877 MTLRNTMTSMTTAASRPTTTNTLSSLTSSILSSTPVPSTEVITSQTTNTTSPSTLVTTLP 936 Query: 493 TTITRSTPTAETTYPISSTSTV 514 TTIT STPT+ETTY S TSTV Sbjct: 937 TTITTSTPTSETTYSTSPTSTV 958 Score = 327 bits (837), Expect = 2e-89 Identities = 241/545 (44%), Positives = 311/545 (57%), Gaps = 50/545 (9%) Query: 4 PSSSVAATDTG-QTTFTSSTATFPETITLTPN--TNMSRE----SLMTPMTSTTPITSAI 56 PSSSV+ATDT TT +S+T T T T + T MS +L T +TST+PITS I Sbjct: 201 PSSSVSATDTTFHTTISSTTRTTERTPLPTGSIHTTMSPTPVFTTLKTAVTSTSPITSTI 260 Query: 57 TPTNTVTSMTTMTSPPTTTNSNSTLSSLTSSILSSTLVPSTDMITSHTTNLTRSSPLLAT 116 T TNTVTSMTT TS PT TN TLSSL S+ILSST VPST+M TSHTT+ S L+ T Sbjct: 261 TSTNTVTSMTTTTSRPTATN---TLSSLMSNILSSTPVPSTEMTTSHTTDTNPLSTLVTT 317 Query: 117 LPTTITRSTPTSETTYPTSPTSTVKGSTTSIRYSTSMTGTLSMETSLPPTSSSLPTTETA 176 LPTTITRSTPTSETTYP SPTSTV STT I YST +TGTLS T+LPPTSSS TTET Sbjct: 318 LPTTITRSTPTSETTYPASPTSTVTDSTTEITYSTVLTGTLSPTTTLPPTSSSQQTTETP 377 Query: 177 TTPTTNLV--TTEITSHSTPSFSSSTIHSTVSTPTTVISSGPPTSGTIVTSITVTPSS-L 233 TPTT LV TTE TS S+ +FSSS I+STVST TT ISS PPTSGT+VTS + P++ L Sbjct: 378 MTPTTKLVTTTTETTSQSSLNFSSSAIYSTVSTSTTAISSLPPTSGTMVTSTNIVPTADL 437 Query: 234 STDIPLTTPTTITHHSVGSTESLLTATDLTSTFTVSSSSAMSTSDIPSSPSIQNTETSSL 293 ++ L + + + + T FT S++++ T+ + + I ++ Sbjct: 438 KPELIL---LEVHDQRIQAKNPRYSQT----PFTSSTATSPETTTLTCTNDISTESLTTA 490 Query: 294 VSMTSATIPSVRPTFTSTHNTLTSSLLTTFPGTYSFSSSMSASSDGTTHTETITSLPAST 353 ++ T+ I ++ P T T T T+S TT T S +S SS +TE ITS +T Sbjct: 491 MTSTTPVISAITPKTTVTSMTTTASGPTT-TNTLSSLTSSILSSTPAPNTEVITSHTTTT 549 Query: 354 ---STLHTTAESTTAHTTTTSFTTSTTMESPSSSVATTSTGQTTFSSSTATFTETTTL-- 408 STL TT + A +T TS TT SP+ +V + T T +S T T++ TTL Sbjct: 550 TPPSTLVTTLPTAIARSTPTSETTYPI--SPTGTVTDSMTEITYSTSMTGTWSTATTLPL 607 Query: 409 ------------TPTTDFSEETLTTAMTSTPPITSSITPTNTVTSMTTMTSWPTATNTLS 456 TPTT+ T T STP TSS + S TT++S+P 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ITTSTPTSETTYSTSPTSTVTDSTTETTYSTSITGTLSTEISLPATTSSLITKGISMTST 998 Query: 181 TNLVTT--EITSHSTPSFSSSTIHSTVSTPTTVISSGPPTSGTIVTSITVTPSSLSTDIP 238 NLVTT E TSHSTP+F + TIHST+ST TT ISS P TSG IVTS T+TPSSL+ DIP Sbjct: 999 RNLVTTTNENTSHSTPTF-TLTIHSTISTSTTAISSVPTTSGPIVTSTTMTPSSLTADIP 1057 Query: 239 LTTPTTI 245 TT TTI Sbjct: 1058 TTTLTTI 1064 Score = 253 bits (645), Expect = 4e-67 Identities = 187/518 (36%), Positives = 277/518 (53%), Gaps = 27/518 (5%) Query: 5 SSSVAATDTGQTTFTSSTATFPETITLTPNTNMSRESLMTPMTSTTPITSAITPTN---T 61 S ++ ++ T T+ T+ F + TP T + + + T+ I + PT+ T Sbjct: 84 SETLLSSLVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVLVYLATTECVYPTSFIITISHPTSICVT 143 Query: 62 VTSMTTMTSPPTTTNSNSTLSSLTSSILSSTLVPSTD-MITSHTTNLTRSSPLLATLPTT 120 T +T +S T + ++++T + +T T MI+S +T R +P++ P++ Sbjct: 144 TTQVTFTSSYTPTPVTQKPVTTVTRTYPMTTTEKGTSAMISSPSTTTARETPIVTVTPSS 203 Query: 121 ITRSTPTSETTYPTSPTSTVKGSTTSIRYSTSMTGTLSMETSLPPTSSSLPTTETATTPT 180 S ++TT+ T T+ +T + + TG++ S P ++L T T+T+P Sbjct: 204 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ESLTTAMTSTTPVISAITPKTTVTSMTTTASGPTTTNTLSSLTSSILSSTPAPNTEVITS 544 Query: 477 HTTNINPVSTLVTTLPTTITRSTPTAETTYPISSTSTV 514 HTT P STLVTTLPT I RSTPT+ETTYPIS T TV Sbjct: 545 HTTTTTPPSTLVTTLPTAIARSTPTSETTYPISPTGTV 582 Score = 199 bits (506), Expect = 5e-51 Identities = 152/345 (44%), Positives = 196/345 (56%), Gaps = 22/345 (6%) Query: 188 ITSHSTPSFSSSTIHS-TVSTPTTVISSGPPTSGTIVTSITVTPSSL-----STDIP-LT 240 +T T F S ++ T+ST T+ P + T+++ +P S +P L Sbjct: 1 MTHGFTSGFLCSAANAGTLSTATSTSHVTFPRAEATRTALSNSPHSRYLAEWPQGVPQLA 60 Query: 241 TPTTITHHSVGSTESLLTATDLTSTFTVSSSSAMSTSDIPSSPSIQNTETSS-LVSMTSA 299 +P + T + L S +SS + +TS P+S ET+ V + A Sbjct: 61 SPAPGHRENAPMTLTTSPHDTLISETLLSSLVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVLVYLA 120 Query: 300 TIPSVRPT-FTSTHNTLTSSLLTTFPGTYSFSSSMSASSDGTTHTETITSLPASTSTLHT 358 T V PT F T + TS +TT T F+SS + + T+T T+T Sbjct: 121 TTECVYPTSFIITISHPTSICVTTTQVT--FTSSYTPTPVTQKPVTTVTRTYPMTTTEKG 178 Query: 359 TAESTTAHTTTTSFTTSTTMESPSSSV-ATTSTGQTTFSSSTATFTET--------TTLT 409 T+ ++ +TTT+ T +PSSSV AT +T TT SS+T T T TT++ Sbjct: 179 TSAMISSPSTTTARETPIVTVTPSSSVSATDTTFHTTISSTTRTTERTPLPTGSIHTTMS 238 Query: 410 PTTDFSEETLTTAMTSTPPITSSITPTNTVTSMTTMTSWPTATNTLSSLTTNILSSTPVP 469 PT F+ TL TA+TST PITS+IT TNTVTSMTT TS PTATNTLSSL +NILSSTPVP Sbjct: 239 PTPVFT--TLKTAVTSTSPITSTITSTNTVTSMTTTTSRPTATNTLSSLMSNILSSTPVP 296 Query: 470 STERTTSHTTNINPVSTLVTTLPTTITRSTPTAETTYPISSTSTV 514 STE TTSHTT+ NP+STLVTTLPTTITRSTPT+ETTYP S TSTV Sbjct: 297 STEMTTSHTTDTNPLSTLVTTLPTTITRSTPTSETTYPASPTSTV 341 Score = 128 bits (321), Expect = 1e-29 Identities = 140/459 (30%), Positives = 225/459 (49%), Gaps = 57/459 (12%) Query: 5 SSSVAATDTGQTTFTSSTATFPETITLTPNTNMSRESLMTPMTSTT--PITS-AITPTNT 61 SS++ +T TT SS P + T+ T M+ SL T +++TT IT ++ T Sbjct: 642 SSAIYSTVNISTTTISSFP--PSSGTMVTFTTMNPSSLSTDISTTTLKNITQPSVGSTGF 699 Query: 62 VTSMTTMTSPPTTTNSNSTLSSLTSSILS-STLVPSTDMITSHTTNLTRSSPLLATLPTT 120 +T+ T +TS T ++S++ +S+T S S ST + T+ TT+ T L +T T Sbjct: 700 LTAATDLTSTFTVSSSSAMSTSVTPSAPSIQNKEISTLVSTTTTTSPTERMTLTSTENTP 759 Query: 121 ITRSTPTSETTYPTSPTSTVKGS----TTSIRYSTSMTGTL--SMETSLPPTSSSLPTTE 174 + TS TY SP+ + T SI + ++T TL + E++L PT+++ TT Sbjct: 760 TSYILTTSPVTYSFSPSMSASSDWTTDTESISSAPAITSTLHTTAESTLAPTTTNSFTTS 819 Query: 175 TATTPTTNLVTTEITSHSTPSFSSST-IHSTVSTPTT----------VISSGPPTSGTIV 223 P + V T T ST + S++T + +T TPTT +IS+ P TS Sbjct: 820 ANMEPPSTAVATTGTGQSTFTSSTATFLETTTLTPTTDISTESFMTPMISTTPITS---- 875 Query: 224 TSITVTPSSLSTDIPLTTPTTITHHSVGSTESLLTATDLTSTFTVSSSSAMSTSDIPSSP 283 S+T+ + S + PTT T+ T S+L++T + ST ++S + +TS Sbjct: 876 -SMTLRNTMTSMTTAASRPTT-TNTLSSLTSSILSSTPVPSTEVITSQTTNTTS------ 927 Query: 284 SIQNTETSSLVSMTSATIPSVRPTFTSTHNTLTSSLLTTFPGTYSFSSSMSASSDGTTHT 343 S+LV+ TI + PT +T++T +S +T ++S+S++ GT T Sbjct: 928 ------PSTLVTTLPTTITTSTPTSETTYSTSPTSTVTDSTTETTYSTSIT----GTLST 977 Query: 344 ETITSLPASTSTLHTTAESTTAHTTTTSFTTSTTMESPSSSVATTSTGQTTFSSSTATFT 403 E SLPA+TS+L T S T+T +TT E+ S S T T T S+ +T T Sbjct: 978 E--ISLPATTSSLITKGIS----MTSTRNLVTTTNENTSHS---TPTFTLTIHSTISTST 1028 Query: 404 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Search results were obtained with NCBI BLAST and RefSeq entries.
Guide to the Human Genome
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