BLASTP 2.2.11 [Jun-05-2005] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= gi|239749213 PREDICTED: mucin 3B, cell surface associated, partial [Homo sapiens] (1063 letters) Database: hs.faa 37,866 sequences; 18,247,518 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gi|239749213 PREDICTED: mucin 3B, cell surface associated, parti... 2119 0.0 gi|239743291 PREDICTED: mucin 3A, intestinal [Homo sapiens] 1892 0.0 gi|239758038 PREDICTED: mucin 3A, cell surface associated, parti... 1246 0.0 gi|169170721 PREDICTED: similar to intestinal mucin [Homo sapiens] 637 0.0 gi|169217681 PREDICTED: similar to hCG1747328, partial [Homo sap... 510 e-144 gi|91982772 mucin 17 [Homo sapiens] 362 1e-99 gi|239758058 PREDICTED: similar to mucin, partial [Homo sapiens] 346 8e-95 gi|239752529 PREDICTED: similar to mucin [Homo sapiens] 322 9e-88 gi|239743293 PREDICTED: mucin 12 [Homo sapiens] 312 9e-85 gi|239754668 PREDICTED: mucin 12 [Homo sapiens] 308 2e-83 gi|239508973 PREDICTED: similar to Mucin-3A [Homo sapiens] 275 2e-73 gi|239508976 PREDICTED: mucin 12, cell surface associated [Homo ... 272 1e-72 gi|89026265 PREDICTED: mucin 12 [Homo sapiens] 272 1e-72 gi|116284392 mucin 2 precursor [Homo sapiens] 245 2e-64 gi|239757995 PREDICTED: similar to hCG1747327, partial [Homo sap... 236 1e-61 gi|239752523 PREDICTED: intestinal mucin-like, partial [Homo sap... 232 1e-60 gi|153945878 mucin 5, subtype B, tracheobronchial [Homo sapiens] 199 2e-50 gi|151301154 mucin 6, gastric [Homo sapiens] 198 3e-50 gi|239740827 PREDICTED: hypothetical protein XP_002344067 [Homo ... 186 8e-47 gi|113417486 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 186 1e-46 gi|239513940 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 186 1e-46 gi|169168665 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 186 1e-46 gi|239740898 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 186 1e-46 gi|239754269 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 185 2e-46 gi|239740674 PREDICTED: hypothetical protein [Homo 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SFTSSNSITD-SRSHSTPPFTSSVTTPEMTSHNTPSFMSSIITTETTSHSTPSFTSSTIH 188 S TS+N++T + + S P T+++++P T T STP ++ TI Sbjct: 262 SITSTNTVTSMTTTASQPTATNTLSSP----------------TRTILSSTPVLSTETIT 305 Query: 189 STVSSSTTAITSPFTTAETGVTSTPSSPSSLSTDIPTTSLRTLTPLSLSTSTSLTTTTDL 248 S ++++T T T T STP+S ++ T +T + T ++ STS + T +T+ Sbjct: 306 SGITNTTPLSTLVTTLPTTISRSTPTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGTLSTET 365 Query: 249 PSIPTDISSLPTPIHIISSSPSIQSTETSSLVGT---TSPTMSTVRATLR-STENTPISS 304 S+P SSLPT T T+P + V T S+ +TP S Sbjct: 366 -SLPPTSSSLPT---------------------TETATTPMTNLVTTTTEISSHSTP--S 401 Query: 305 FSTSIVVTPETPTTQAPPVLMSATGTQTSPVPTTVTFGSMDSSTSTLHTLTPSTALSKIM 364 FS+S + + T T+ + P S+ T +P +T F S ++T T +PS + ++ Sbjct: 402 FSSSTIYS--TVTSHSTPRFTSSITTTETPSHSTPRFTSSFTNTKTTSHRSPS--FTSLI 457 Query: 365 STSQFPIPSTHSSTLQTTPSIPSLQTSLTSTSEFTTESFTRGSTSTNAILTSFSTIIWSS 424 +T++ +T +TPS S T+ T T+ + SFT T+T TS +T ++S Sbjct: 458 TTTE--------TTSHSTPSFTSSITT-TETTSHSARSFTSSITTTET--TSHNTRSFTS 506 Query: 425 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TVTSMTTTASQPTATNTLSSPTRTILSSTPVLSTETITSGITNTT--PLSTLVTTLPTTI 325 Query: 560 SMQTTLATHMDTSSMT-PESESSIIPNASSSTGTGTVPTNTVFTSTRLPTSETWLSNNSV 618 S T TS T P S +S + ++++ T T T+ T T LP + + L Sbjct: 326 SRST------PTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGTLSTETSLPPTSSSLPTTET 379 Query: 619 IPTPLPGVSTIPLTMKPSSSLPTILRTSSKSTHPSPPTARTSETSVATTQTPTTLTTRRT 678 TP+ + T T S S P+ ++ ST S T R + +S+ TT+TP+ T R T Sbjct: 380 ATTPMTNLVT-TTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSHSTPRFT-SSITTTETPSHSTPRFT 437 Query: 679 TPITSWMTTQ-------STLTTTAGT 697 + T+ TT S +TTT T Sbjct: 438 SSFTNTKTTSHRSPSFTSLITTTETT 463 Score = 71.6 bits (174), Expect = 4e-12 Identities = 80/302 (26%), Positives = 122/302 (40%), Gaps = 23/302 (7%) Query: 407 STSTNAILTSFSTIIW--SSTPTIIMSSSPSSASIT--PVFATTIHSVPSSPYIFSTENV 462 +T T + TS S + + + + ++S+SP S + P+ + +SP EN Sbjct: 19 ATGTLSTATSISQVPFPRAEAASAVLSNSPHSRDLAGWPLGVPQL----ASPAPGHRENA 74 Query: 463 GSASITAFPSLSSSSTTSTSPTSSSLTTALT-------EITPFSYISLPSTTPCPGTITI 515 T+ S T SP SS+ +T T E TP + + +TT C + Sbjct: 75 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STHPSPPTARTSETSVATTQTPTTLTTRRTTPITSWMTTQSTLTTTAGTCDNGGTWEQGQ 708 STHPSPPT RTSET VATTQTPTTLT+RRTT ITS MTTQSTLTTTAGTCDNGGTWEQGQ Sbjct: 798 STHPSPPTTRTSETPVATTQTPTTLTSRRTTRITSQMTTQSTLTTTAGTCDNGGTWEQGQ 857 Query: 709 CACLPGFSGDRCQLQTRCQNGGQWDGLKCQCPSTFYGSSCEFAVEQVDL 757 CACLPGFSGDRCQLQTRCQNGGQWDGLKCQCPSTFYGSSCEFAVEQVDL Sbjct: 858 CACLPGFSGDRCQLQTRCQNGGQWDGLKCQCPSTFYGSSCEFAVEQVDL 906 Score = 67.4 bits (163), Expect = 7e-11 Identities = 73/238 (30%), Positives = 111/238 (46%), Gaps = 23/238 (9%) Query: 471 PSLSSSSTTSTSPTSS--SLTTALTEITPFSYISLPSTTPCPGTITITIVPASPTDPCVE 528 PS +SS TT+ +P+SS S T+++T S+ S PS T +I+ T + T Sbjct: 12 PSFTSSITTTETPSSSTPSFTSSITTTETTSH-STPSFT---SSISTTETTSHSTPSFTS 67 Query: 529 MDPSTEATSPPTTPLTVFPFTTEMVTCPSSISMQTTLATHMDTSSMTPESESSIIPNASS 588 + TE TS T T TTE + S+ S T++ T S TP SSI ++ Sbjct: 68 LITITETTSHSTPSYTTSITTTETPS-HSTPSYTTSITTTETPSHSTPSFTSSITTTETT 126 Query: 589 STGTGTVPTNTVFTSTRLPTSETWLSNNSVIPTPLPG----VSTIPLTMKPSSSLP---- 640 S T + ++ T T ++ ++ S+N++ T +++I T PSSS P Sbjct: 127 SHSTPSFTSSIRTTETTSYSTPSFTSSNTITETTSHSTPSYITSITTTETPSSSTPSFSS 186 Query: 641 --TILRTSSKSTHPSPPTARTSETSVATTQT-----PTTLTTRRTTP-ITSWMTTQST 690 T T+S ST + T+ET+ +T + TT TT TP TS +TT T Sbjct: 187 SITTTETTSHSTPGFTSSITTTETTSHSTPSFTSSITTTETTSHDTPSFTSSITTSET 244 Score = 55.5 bits (132), Expect = 3e-07 Identities = 63/219 (28%), Positives = 92/219 (42%), Gaps = 16/219 (7%) Query: 513 ITITIVPASPTDPCVEMDPSTEATSPPTTPLTVFPFTTEMVTCPSSISMQTTLATHMDTS 572 IT + P+ T P +T T +TP TT T S+ S ++++T TS Sbjct: 1 ITTSETPSHRT-PSFTSSITTTETPSSSTPSFTSSITTTETTSHSTPSFTSSISTTETTS 59 Query: 573 SMTPESESSIIPNASSSTGTGTVPTNTVFTSTRLPTSETWLSNNSVIPTPLPGVSTIPLT 632 TP S I + +T T T T+T P+ T S+ T P ST T Sbjct: 60 HSTPSFTSLI--TITETTSHSTPSYTTSITTTETPSHSTPSYTTSITTTETPSHSTPSFT 117 Query: 633 MKPSSSLPTILRTSSKSTHPSPPTARTSETSVATTQTPT-----TLTTRRTTP--ITSWM 685 S T T+S ST + RT+ET+ +T + T T TT +TP ITS Sbjct: 118 -----SSITTTETTSHSTPSFTSSIRTTETTSYSTPSFTSSNTITETTSHSTPSYITSIT 172 Query: 686 TTQSTLTTTAGTCDNGGTWEQGQCACLPGFSGDRCQLQT 724 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Search results were obtained with NCBI BLAST and RefSeq entries.
Guide to the Human Genome
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