BLASTP 2.2.11 [Jun-05-2005] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= gi|239740827 PREDICTED: hypothetical protein XP_002344067 [Homo sapiens] (1521 letters) Database: hs.faa 37,866 sequences; 18,247,518 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gi|239740827 PREDICTED: hypothetical protein XP_002344067 [Homo ... 2850 0.0 gi|169168665 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2848 0.0 gi|239513940 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2847 0.0 gi|239740898 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2845 0.0 gi|239754269 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2840 0.0 gi|239740674 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2840 0.0 gi|239740645 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2840 0.0 gi|113417486 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2814 0.0 gi|239740724 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2812 0.0 gi|239740777 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 2809 0.0 gi|116284392 mucin 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... 221 3e-57 gi|239749217 PREDICTED: similar to Mucin-12, partial [Homo sapiens] 214 4e-55 gi|161016767 mucin 21 [Homo sapiens] 213 9e-55 gi|59710093 G-protein coupled receptor 112 [Homo sapiens] 201 4e-51 gi|239749213 PREDICTED: mucin 3B, cell surface associated, parti... 186 1e-46 >gi|239740827 PREDICTED: hypothetical protein XP_002344067 [Homo sapiens] Length = 1521 Score = 2850 bits (7389), Expect = 0.0 Identities = 1521/1521 (100%), Positives = 1521/1521 (100%) Query: 1 MSSETTVAPAAGSNTTTASTTGSETTTILIKASETTTASTAGSETTTPSPTGSQTTIVSI 60 MSSETTVAPAAGSNTTTASTTGSETTTILIKASETTTASTAGSETTTPSPTGSQTTIVSI Sbjct: 1 MSSETTVAPAAGSNTTTASTTGSETTTILIKASETTTASTAGSETTTPSPTGSQTTIVSI 60 Query: 61 SGSEITTTSTAGSENTTVSSAGSGTTTASMAGSETTVSTAGSETTTVSITGTETTMVSAM 120 SGSEITTTSTAGSENTTVSSAGSGTTTASMAGSETTVSTAGSETTTVSITGTETTMVSAM Sbjct: 61 SGSEITTTSTAGSENTTVSSAGSGTTTASMAGSETTVSTAGSETTTVSITGTETTMVSAM 120 Query: 121 GSETTTNSTTSSETTVTSTAGSETTTVSTVGSETTTAYTADSETTAASTTGSEMTTVFTA 180 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[Homo sapiens] Length = 861 Score = 214 bits (546), Expect = 4e-55 Identities = 247/870 (28%), Positives = 382/870 (43%), Gaps = 79/870 (9%) Query: 391 SEATTVSTTGSETTTVSI-TDSETTTTCTEGSEMTAVSTTVFETTTASTEGSEITIASTS 449 S +T ++ G TT+ S + S+ TT ++ VS T F T + +T+ + ++ Sbjct: 21 SSSTVNTSIGGNTTSASTPSSSDPFTTFSD----YGVSVT-FITGSTATKHFLDSSTNSG 75 Query: 450 DSETTTASTEGSETTTVTTAGSETKTAYTTGS-ETTTASNTGLETTTVFTIGSDTTTAST 508 SE +T S G T T S + T+ G +T+ ++ +ETT + TTTA Sbjct: 76 HSEESTVSHSGPGATGTTLFPSHSATSVFVGEPKTSPITSASMETTA---LPGSTTTAGL 132 Query: 509 EGSETTAVSATGSEMTTVSTEGSENTTVSTTGSETTTVSTTGLETTTTSTEGSEMTTVST 568 TT S+ S T+S + ++ VS TT+ S G T + + M VS Sbjct: 133 SEKSTTFYSSPRSPDRTLSPARTTSSGVSE--KSTTSHSRPGPTHTIAFPDSTTMPGVSQ 190 Query: 569 TGAET-----TTDSTEGSGTTAASTAGSETTTVSTADSENTTASTADSETTSA------- 616 + +TD+T GTT S+ G E+TT ++ T D+ TTS Sbjct: 191 ESTASHSIPGSTDTTLSPGTTTPSSLGPESTTFHSSPGYTKTTRLPDNTTTSGLLEASTP 250 Query: 617 --STTGSETTTASTTSSETTTASTEGSETTTVSTTDSETTMVSTTGSERT---ITSTEGS 671 S+TGS TT S +SS T 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Search results were obtained with NCBI BLAST and RefSeq entries.
Guide to the Human Genome
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