BLASTP 2.2.11 [Jun-05-2005] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= gi|239508973 PREDICTED: similar to Mucin-3A [Homo sapiens] (596 letters) Database: hs.faa 37,866 sequences; 18,247,518 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gi|239508973 PREDICTED: similar to Mucin-3A [Homo sapiens] 1174 0.0 gi|239743291 PREDICTED: mucin 3A, intestinal [Homo sapiens] 843 0.0 gi|239757995 PREDICTED: similar to hCG1747327, partial [Homo sap... 669 0.0 gi|169171411 PREDICTED: mucin 3B, partial [Homo sapiens] 489 e-138 gi|169171850 PREDICTED: similar to intestinal mucin MUC3B [Homo ... 420 e-117 gi|239758038 PREDICTED: mucin 3A, cell surface associated, parti... 325 9e-89 gi|239752523 PREDICTED: intestinal mucin-like, partial [Homo sap... 324 2e-88 gi|239749213 PREDICTED: mucin 3B, cell surface associated, parti... 275 1e-73 gi|116284392 mucin 2 precursor [Homo sapiens] 196 4e-50 gi|91982772 mucin 17 [Homo sapiens] 185 1e-46 gi|239749951 PREDICTED: similar to mucin 2 [Homo sapiens] 184 2e-46 gi|153945878 mucin 5, subtype B, tracheobronchial [Homo sapiens] 157 3e-38 gi|239752529 PREDICTED: similar to mucin [Homo sapiens] 150 3e-36 gi|161019170 mucin 5AC [Homo sapiens] 148 1e-35 gi|239740827 PREDICTED: hypothetical protein XP_002344067 [Homo ... 146 6e-35 gi|239754269 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|169168665 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|113417486 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|239740898 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|239740777 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|239740724 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|239740674 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|239740645 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|239513940 PREDICTED: hypothetical protein [Homo sapiens] 144 2e-34 gi|151301154 mucin 6, gastric [Homo sapiens] 144 3e-34 gi|239758058 PREDICTED: similar to mucin, partial [Homo sapiens] 141 2e-33 gi|239740773 PREDICTED: similar to diffuse panbronchiolitis crit... 129 1e-29 gi|167736355 mucin 4 isoform a [Homo sapiens] 127 2e-29 gi|239743293 PREDICTED: mucin 12 [Homo sapiens] 118 2e-26 gi|16554449 zonadhesin isoform 3 [Homo sapiens] 116 5e-26 >gi|239508973 PREDICTED: similar to Mucin-3A [Homo sapiens] Length = 596 Score = 1174 bits (3037), Expect = 0.0 Identities = 596/596 (100%), Positives = 596/596 (100%) Query: 1 MQLLGLLGLLWMLKASPWATGTLSTATSISQVPFPRAEAASAVLSNSPHSRDLAGWPLGV 60 MQLLGLLGLLWMLKASPWATGTLSTATSISQVPFPRAEAASAVLSNSPHSRDLAGWPLGV Sbjct: 1 MQLLGLLGLLWMLKASPWATGTLSTATSISQVPFPRAEAASAVLSNSPHSRDLAGWPLGV 60 Query: 61 PQLASPAPGHRENAPMTLTTSPHDTLISETLLNSPVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVL 120 PQLASPAPGHRENAPMTLTTSPHDTLISETLLNSPVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVL Sbjct: 61 PQLASPAPGHRENAPMTLTTSPHDTLISETLLNSPVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVL 120 Query: 121 VYSATTECVYPTSFIITISHPTSICVTTTQVAFTSSYTSTPVTQKPVTTVTSTYSMTTTE 180 VYSATTECVYPTSFIITISHPTSICVTTTQVAFTSSYTSTPVTQKPVTTVTSTYSMTTTE Sbjct: 121 VYSATTECVYPTSFIITISHPTSICVTTTQVAFTSSYTSTPVTQKPVTTVTSTYSMTTTE 180 Query: 181 KGTSAMTSSPSTTTARETPIVTVTPSSVSATDTTFHTTISSTTRTTERTPLPTGSIHTTT 240 KGTSAMTSSPSTTTARETPIVTVTPSSVSATDTTFHTTISSTTRTTERTPLPTGSIHTTT Sbjct: 181 KGTSAMTSSPSTTTARETPIVTVTPSSVSATDTTFHTTISSTTRTTERTPLPTGSIHTTT 240 Query: 241 SPTPVFTTLKTAVTSTSPITSSITSTNTVTSMTTTASQPTATNTLSSPTRTILSSTPVLS 300 SPTPVFTTLKTAVTSTSPITSSITSTNTVTSMTTTASQPTATNTLSSPTRTILSSTPVLS Sbjct: 241 SPTPVFTTLKTAVTSTSPITSSITSTNTVTSMTTTASQPTATNTLSSPTRTILSSTPVLS 300 Query: 301 TETITSGITNTTPLSTLVTTLPTTISRSTPTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGT 360 TETITSGITNTTPLSTLVTTLPTTISRSTPTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGT Sbjct: 301 TETITSGITNTTPLSTLVTTLPTTISRSTPTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGT 360 Query: 361 LSTETSLPPTSSSLPTTETATTPMTNLVTTTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSHISTSTT 420 LSTETSLPPTSSSLPTTETATTPMTNLVTTTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSHISTSTT Sbjct: 361 LSTETSLPPTSSSLPTTETATTPMTNLVTTTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSHISTSTT 420 Query: 421 AITSHFTTSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTDIS 480 AITSHFTTSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTDIS Sbjct: 421 AITSHFTTSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTDIS 480 Query: 481 TLPTRTHIISSSPSIQSTETSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFSTSTCDNGGTW 540 TLPTRTHIISSSPSIQSTETSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFSTSTCDNGGTW Sbjct: 481 TLPTRTHIISSSPSIQSTETSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFSTSTCDNGGTW 540 Query: 541 EQGQCACLPGFSGDRCQLQTRCQNGGQWDGLKCQCPSTFYGSSCEFAVEQVDLGCH 596 EQGQCACLPGFSGDRCQLQTRCQNGGQWDGLKCQCPSTFYGSSCEFAVEQVDLGCH Sbjct: 541 EQGQCACLPGFSGDRCQLQTRCQNGGQWDGLKCQCPSTFYGSSCEFAVEQVDLGCH 596 >gi|239743291 PREDICTED: mucin 3A, intestinal [Homo sapiens] Length = 1486 Score = 843 bits (2179), Expect = 0.0 Identities = 463/562 (82%), Positives = 484/562 (86%), Gaps = 16/562 (2%) Query: 1 MQLLGLLGLLWMLKASPWATGTLSTATSISQVPFPRAEAASAVLSNSPHSRDLAGWPLGV 60 MQLLGLLGLLWMLKASPWATGTLSTATSISQVPFPRAEAASAVLSNSPHSRDLAGWPLGV Sbjct: 1 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TETITSGITNTTPLSTLVTTLPTTISRSTPTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGT Sbjct: 301 TETITSGITNTTPLSTLVTTLPTTISRSTPTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGT 360 Query: 361 LSTETSLPPTSSSLPTTETATTPMTNLVTTTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSHISTSTT 420 LSTETSLPPTSSSLPTTETATTPMTNLVTTTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSH ST Sbjct: 361 LSTETSLPPTSSSLPTTETATTPMTNLVTTTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSH---STP 417 Query: 421 AITSHFTTSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTDIS 480 TS TT+ET TP SS T+ TTS R+ + +S+ T+T TT+ PS + I+ Sbjct: 418 RFTSSITTTETPSHSTPRFTSSF-TNTKTTSHRSPSFTSLITTTE-TTSHSTPSFTSSIT 475 Query: 481 TLPTRTHIISS-SPSIQSTE---------TSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFS 530 T T +H S + SI +TE TSS+ T + + ST T IT T +S S Sbjct: 476 TTETTSHSARSFTSSITTTETTSHNTRSFTSSITTTETNSHSTTSFTSSIT-TTETTSHS 534 Query: 531 TSTCDNGGTWEQGQCACLPGFS 552 T + + T + PG + Sbjct: 535 TPSFSSSITTTETPLHSTPGLT 556 Score = 360 bits (923), Expect = 3e-99 Identities = 256/534 (47%), Positives = 327/534 (61%), Gaps = 47/534 (8%) Query: 16 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TETITSGITNTTPLSTLVTTLPTTISRSTPTSETTYPTSPTSTVTDSTTKIAYSTSMTGT 360 TET + +TT ++ +TT TT S STP+ + +S T+T T + ++ +T T Sbjct: 511 TETNSH---STTSFTSSITTTETT-SHSTPS----FSSSITTTETPLHSTPGLTSWVTTT 562 Query: 361 LSTETSLPPTSSSLPTTETAT--TPMTNLVTTTTEISSHSTPSFSSSTIYSTVTSHISTS 418 +T P +SS+ TTET + TP TTTE +S STPS SSSTIYSTV STS Sbjct: 563 KTTSHITPGLTSSITTTETTSHSTPGFTSSITTTETTSESTPSLSSSTIYSTV----STS 618 Query: 419 TTAITSHFTTSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTD 478 TTAITSHFTTSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTD Sbjct: 619 TTAITSHFTTSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTD 678 Query: 479 ISTLPTRTHIISSSPSIQSTETSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFSTS 532 ISTLPTRTHIISSSPSIQSTETSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFSTS Sbjct: 679 ISTLPTRTHIISSSPSIQSTETSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFSTS 732 Score = 263 bits (673), Expect = 3e-70 Identities = 215/608 (35%), Positives = 315/608 (51%), Gaps = 96/608 (15%) Query: 68 PGHRENAPMTLTTSPHDTLISETLLNSPVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVLVYSATTE 127 PG + T TTS +S + 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TSETAVTPTPVTPSSLSTDIPTTSLRTLTPSSVGTSTSLTTTTDFPSIPTDISTLPTRTH 487 T+ + T + S STD TT T T S+ G+ T TT + S T +ST + T Sbjct: 348 TTGSETTTASIMGSETSTD-STTGSETTTASTEGSET--TTASTEGSEATTVSTTGSETT 404 Query: 488 IISSSPSIQSTETSSLVGTTSPTMSTVRMTLRITENTPISSFSTS 532 +S + S +T + T+ + + T TE + I+ STS Sbjct: 405 TVSITDSETTTTCTEGSEMTAVSTTVFETTTASTEGSEITIASTS 449 Score = 122 bits (305), Expect = 1e-27 Identities = 155/549 (28%), Positives = 227/549 (41%), Gaps = 46/549 (8%) Query: 12 MLKASPWATGTLSTATSISQVPFPRAEAASAVLSNSPHSRDLAGWPLGVPQLASPAPGHR 71 ++KAS T T STA S + P P + + ++S S S A Sbjct: 29 LIKASE--TTTASTAGSETTTPSPTG-SQTTIVSISGSEITTTSTAGSENTTVSSAGSGT 85 Query: 72 ENAPMTLTTSPHDTLISETLLNSPVSSNTSTTPTSKFAFKVETTPPTVLVYSATTECVYP 131 A M + + T SET S + T TT S + T T + T+ Sbjct: 86 TTASMAGSETTVSTAGSETTTVS--ITGTETTMVSAMGSETTTNSTTSSETTVTSTAGSE 143 Query: 132 TSFIITISHPTSICVTTTQVAFTSSYTSTPVTQKPVTTVTSTYSMTTTEKGTSAMTSSPS 191 T+ + T+ T TT S T+ T +TTV + S T T + T++ S Sbjct: 144 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Guide to the Human Genome
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